Die Protein-Kristallographie-Refinement ist ein entscheidender Schritt in der strukturellen Biologie, der darauf abzielt, die Qualität und Genauigkeit der aus Kristallstrukturdaten gewonnenen Modelle zu verbessern. Nach der ersten Lösung der Struktur wird ein anfängliches Modell erstellt, das dann durch verschiedene Refinement-Techniken optimiert wird. Dabei werden die Unterschiede zwischen den experimentell beobachteten und den berechneten Röntgenbeugungsmustern minimiert. Dies geschieht häufig durch die Anpassung von Atomen, die Verbesserung der Geometrie und die Minimierung von Energie. Typische Verfahren sind das Least Squares Refinement, bei dem der Unterschied zwischen den beobachteten und vorhergesagten Intensitäten minimiert wird, sowie die Verwendung von B-Faktoren, um die thermische Bewegung von Atomen zu berücksichtigen. Letztendlich resultiert dieser Prozess in einer verfeinerten Struktur, die ein genaueres Bild der räumlichen Anordnung von Atomen im Protein vermittelt.
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